Protein–RNA interactions for Protein: P48995

TRPC1, Short transient receptor potential channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1P48995 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRPC1P48995 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms