Protein–RNA interactions for Protein: P47870

GABRB2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB2P47870 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GABRB2P47870 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms