Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACADSBP45954 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms