Protein–RNA interactions for Protein: P43005

SLC1A1, Excitatory amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A1P43005 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC1A1P43005 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms