Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms