Protein–RNA interactions for Protein: P32969

RPL9, 60S ribosomal protein L9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL9P32969 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL9P32969 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL9P32969 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL9P32969 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL9P32969 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL9P32969 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL9P32969 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL9P32969 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL9P32969 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL9P32969 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL9P32969 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL9P32969 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL9P32969 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL9P32969 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL9P32969 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL9P32969 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL9P32969 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL9P32969 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL9P32969 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL9P32969 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL9P32969 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL9P32969 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL9P32969 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL9P32969 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL9P32969 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL9P32969 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL9P32969 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL9P32969 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL9P32969 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL9P32969 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL9P32969 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL9P32969 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL9P32969 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL9P32969 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL9P32969 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL9P32969 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL9P32969 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL9P32969 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL9P32969 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL9P32969 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL9P32969 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL9P32969 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL9P32969 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL9P32969 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL9P32969 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL9P32969 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL9P32969 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL9P32969 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL9P32969 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL9P32969 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL9P32969 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL9P32969 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL9P32969 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL9P32969 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL9P32969 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL9P32969 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL9P32969 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL9P32969 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL9P32969 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL9P32969 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL9P32969 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL9P32969 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL9P32969 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL9P32969 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL9P32969 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL9P32969 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL9P32969 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL9P32969 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL9P32969 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL9P32969 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL9P32969 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL9P32969 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL9P32969 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL9P32969 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL9P32969 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL9P32969 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL9P32969 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL9P32969 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL9P32969 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL9P32969 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL9P32969 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL9P32969 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL9P32969 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL9P32969 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL9P32969 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL9P32969 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL9P32969 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL9P32969 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL9P32969 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL9P32969 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL9P32969 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPL9P32969 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPL9P32969 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPL9P32969 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPL9P32969 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPL9P32969 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPL9P32969 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPL9P32969 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPL9P32969 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPL9P32969 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms