Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TSPOP30536 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TSPOP30536 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TSPOP30536 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TSPOP30536 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TSPOP30536 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TSPOP30536 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TSPOP30536 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TSPOP30536 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TSPOP30536 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TSPOP30536 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TSPOP30536 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TSPOP30536 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TSPOP30536 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TSPOP30536 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TSPOP30536 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TSPOP30536 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TSPOP30536 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TSPOP30536 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
TSPOP30536 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TSPOP30536 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TSPOP30536 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TSPOP30536 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TSPOP30536 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TSPOP30536 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TSPOP30536 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TSPOP30536 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TSPOP30536 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TSPOP30536 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TSPOP30536 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TSPOP30536 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TSPOP30536 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TSPOP30536 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TSPOP30536 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TSPOP30536 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TSPOP30536 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TSPOP30536 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TSPOP30536 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
TSPOP30536 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TSPOP30536 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TSPOP30536 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TSPOP30536 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TSPOP30536 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TSPOP30536 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
TSPOP30536 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
TSPOP30536 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TSPOP30536 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TSPOP30536 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TSPOP30536 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TSPOP30536 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TSPOP30536 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TSPOP30536 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TSPOP30536 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TSPOP30536 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TSPOP30536 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TSPOP30536 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TSPOP30536 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TSPOP30536 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TSPOP30536 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TSPOP30536 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TSPOP30536 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TSPOP30536 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TSPOP30536 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TSPOP30536 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TSPOP30536 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TSPOP30536 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TSPOP30536 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TSPOP30536 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TSPOP30536 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TSPOP30536 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TSPOP30536 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TSPOP30536 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TSPOP30536 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TSPOP30536 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
TSPOP30536 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TSPOP30536 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TSPOP30536 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TSPOP30536 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
TSPOP30536 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
TSPOP30536 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.47
TSPOP30536 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
TSPOP30536 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
TSPOP30536 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TSPOP30536 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TSPOP30536 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
TSPOP30536 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TSPOP30536 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
TSPOP30536 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
TSPOP30536 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TSPOP30536 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
TSPOP30536 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TSPOP30536 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TSPOP30536 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
TSPOP30536 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TSPOP30536 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TSPOP30536 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
TSPOP30536 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
TSPOP30536 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
TSPOP30536 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TSPOP30536 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms