Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms