Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms