Protein–RNA interactions for Protein: P26045

PTPN3, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 3, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN3P26045 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN3P26045 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN3P26045 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN3P26045 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN3P26045 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN3P26045 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN3P26045 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN3P26045 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN3P26045 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN3P26045 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN3P26045 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN3P26045 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN3P26045 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN3P26045 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN3P26045 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN3P26045 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN3P26045 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN3P26045 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN3P26045 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN3P26045 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN3P26045 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN3P26045 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN3P26045 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN3P26045 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN3P26045 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN3P26045 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN3P26045 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN3P26045 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN3P26045 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN3P26045 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN3P26045 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN3P26045 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN3P26045 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN3P26045 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN3P26045 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN3P26045 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN3P26045 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN3P26045 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN3P26045 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN3P26045 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN3P26045 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN3P26045 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN3P26045 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN3P26045 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN3P26045 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN3P26045 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN3P26045 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN3P26045 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN3P26045 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN3P26045 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN3P26045 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN3P26045 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN3P26045 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN3P26045 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN3P26045 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN3P26045 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN3P26045 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN3P26045 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN3P26045 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN3P26045 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN3P26045 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN3P26045 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN3P26045 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN3P26045 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN3P26045 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN3P26045 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN3P26045 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN3P26045 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN3P26045 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN3P26045 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN3P26045 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN3P26045 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN3P26045 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN3P26045 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN3P26045 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN3P26045 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN3P26045 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN3P26045 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN3P26045 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN3P26045 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN3P26045 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN3P26045 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN3P26045 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN3P26045 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN3P26045 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN3P26045 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN3P26045 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN3P26045 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN3P26045 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN3P26045 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN3P26045 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN3P26045 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN3P26045 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN3P26045 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN3P26045 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN3P26045 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN3P26045 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN3P26045 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN3P26045 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN3P26045 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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