Protein–RNA interactions for Protein: P24863

CCNC, Cyclin-C, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNCP24863 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCNCP24863 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CCNCP24863 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCNCP24863 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCNCP24863 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCNCP24863 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCNCP24863 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCNCP24863 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCNCP24863 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCNCP24863 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCNCP24863 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCNCP24863 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCNCP24863 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCNCP24863 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCNCP24863 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCNCP24863 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCNCP24863 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCNCP24863 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCNCP24863 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCNCP24863 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCNCP24863 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCNCP24863 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCNCP24863 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCNCP24863 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCNCP24863 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCNCP24863 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCNCP24863 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCNCP24863 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCNCP24863 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCNCP24863 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCNCP24863 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCNCP24863 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCNCP24863 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCNCP24863 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCNCP24863 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCNCP24863 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCNCP24863 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCNCP24863 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCNCP24863 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCNCP24863 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCNCP24863 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCNCP24863 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCNCP24863 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCNCP24863 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCNCP24863 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCNCP24863 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCNCP24863 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCNCP24863 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCNCP24863 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCNCP24863 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCNCP24863 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CCNCP24863 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCNCP24863 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCNCP24863 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CCNCP24863 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CCNCP24863 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCNCP24863 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCNCP24863 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCNCP24863 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCNCP24863 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCNCP24863 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCNCP24863 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCNCP24863 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCNCP24863 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCNCP24863 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCNCP24863 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCNCP24863 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCNCP24863 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCNCP24863 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCNCP24863 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCNCP24863 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCNCP24863 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCNCP24863 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCNCP24863 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCNCP24863 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCNCP24863 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCNCP24863 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCNCP24863 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCNCP24863 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCNCP24863 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCNCP24863 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCNCP24863 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCNCP24863 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCNCP24863 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCNCP24863 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CCNCP24863 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCNCP24863 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCNCP24863 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CCNCP24863 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCNCP24863 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCNCP24863 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCNCP24863 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CCNCP24863 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCNCP24863 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCNCP24863 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCNCP24863 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCNCP24863 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCNCP24863 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCNCP24863 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCNCP24863 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms