Protein–RNA interactions for Protein: P19838

NFKB1, Nuclear factor NF-kappa-B p105 subunit, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKB1P19838 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NFKB1P19838 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NFKB1P19838 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NFKB1P19838 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NFKB1P19838 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NFKB1P19838 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NFKB1P19838 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NFKB1P19838 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NFKB1P19838 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NFKB1P19838 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NFKB1P19838 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NFKB1P19838 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NFKB1P19838 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NFKB1P19838 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NFKB1P19838 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NFKB1P19838 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NFKB1P19838 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NFKB1P19838 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NFKB1P19838 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NFKB1P19838 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NFKB1P19838 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NFKB1P19838 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NFKB1P19838 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NFKB1P19838 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NFKB1P19838 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NFKB1P19838 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NFKB1P19838 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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NFKB1P19838 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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NFKB1P19838 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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NFKB1P19838 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NFKB1P19838 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NFKB1P19838 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NFKB1P19838 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NFKB1P19838 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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NFKB1P19838 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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NFKB1P19838 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NFKB1P19838 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NFKB1P19838 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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NFKB1P19838 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NFKB1P19838 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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NFKB1P19838 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NFKB1P19838 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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NFKB1P19838 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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NFKB1P19838 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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NFKB1P19838 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NFKB1P19838 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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NFKB1P19838 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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NFKB1P19838 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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NFKB1P19838 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NFKB1P19838 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NFKB1P19838 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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NFKB1P19838 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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NFKB1P19838 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NFKB1P19838 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NFKB1P19838 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NFKB1P19838 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NFKB1P19838 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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