Protein–RNA interactions for Protein: P19075

TSPAN8, Tetraspanin-8, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN8P19075 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSPAN8P19075 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms