Protein–RNA interactions for Protein: P19013

KRT4, Keratin, type II cytoskeletal 4, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT4P19013 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT4P19013 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT4P19013 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT4P19013 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT4P19013 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT4P19013 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT4P19013 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT4P19013 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT4P19013 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT4P19013 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT4P19013 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT4P19013 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT4P19013 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT4P19013 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT4P19013 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT4P19013 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT4P19013 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT4P19013 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT4P19013 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT4P19013 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT4P19013 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT4P19013 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT4P19013 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT4P19013 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT4P19013 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT4P19013 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT4P19013 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT4P19013 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT4P19013 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT4P19013 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT4P19013 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT4P19013 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT4P19013 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT4P19013 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT4P19013 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT4P19013 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT4P19013 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT4P19013 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT4P19013 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT4P19013 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT4P19013 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT4P19013 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT4P19013 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT4P19013 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT4P19013 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT4P19013 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT4P19013 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT4P19013 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT4P19013 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT4P19013 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT4P19013 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT4P19013 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT4P19013 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT4P19013 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT4P19013 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT4P19013 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT4P19013 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT4P19013 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT4P19013 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT4P19013 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT4P19013 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT4P19013 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT4P19013 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT4P19013 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT4P19013 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT4P19013 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT4P19013 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT4P19013 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT4P19013 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT4P19013 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT4P19013 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT4P19013 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT4P19013 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT4P19013 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT4P19013 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT4P19013 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT4P19013 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT4P19013 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT4P19013 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT4P19013 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT4P19013 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT4P19013 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT4P19013 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT4P19013 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT4P19013 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT4P19013 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT4P19013 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT4P19013 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT4P19013 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT4P19013 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT4P19013 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT4P19013 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT4P19013 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT4P19013 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT4P19013 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT4P19013 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT4P19013 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT4P19013 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT4P19013 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT4P19013 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms