Protein–RNA interactions for Protein: P17900

GM2A, Ganglioside GM2 activator, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GM2AP17900 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GM2AP17900 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GM2AP17900 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GM2AP17900 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GM2AP17900 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GM2AP17900 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GM2AP17900 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GM2AP17900 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GM2AP17900 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GM2AP17900 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GM2AP17900 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GM2AP17900 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GM2AP17900 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GM2AP17900 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GM2AP17900 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GM2AP17900 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GM2AP17900 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GM2AP17900 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GM2AP17900 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GM2AP17900 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GM2AP17900 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GM2AP17900 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GM2AP17900 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GM2AP17900 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GM2AP17900 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GM2AP17900 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GM2AP17900 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GM2AP17900 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GM2AP17900 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GM2AP17900 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GM2AP17900 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GM2AP17900 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GM2AP17900 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GM2AP17900 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GM2AP17900 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GM2AP17900 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GM2AP17900 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GM2AP17900 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GM2AP17900 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GM2AP17900 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GM2AP17900 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GM2AP17900 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GM2AP17900 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GM2AP17900 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GM2AP17900 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GM2AP17900 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GM2AP17900 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GM2AP17900 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GM2AP17900 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GM2AP17900 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GM2AP17900 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GM2AP17900 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GM2AP17900 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GM2AP17900 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GM2AP17900 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GM2AP17900 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GM2AP17900 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GM2AP17900 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GM2AP17900 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GM2AP17900 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GM2AP17900 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GM2AP17900 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GM2AP17900 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GM2AP17900 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GM2AP17900 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GM2AP17900 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GM2AP17900 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GM2AP17900 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GM2AP17900 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GM2AP17900 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GM2AP17900 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GM2AP17900 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GM2AP17900 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GM2AP17900 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GM2AP17900 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GM2AP17900 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GM2AP17900 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GM2AP17900 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GM2AP17900 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GM2AP17900 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GM2AP17900 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GM2AP17900 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GM2AP17900 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GM2AP17900 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GM2AP17900 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GM2AP17900 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GM2AP17900 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GM2AP17900 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GM2AP17900 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GM2AP17900 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GM2AP17900 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GM2AP17900 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GM2AP17900 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GM2AP17900 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GM2AP17900 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GM2AP17900 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GM2AP17900 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GM2AP17900 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GM2AP17900 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GM2AP17900 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms