Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
XBP1P17861 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
XBP1P17861 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
XBP1P17861 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
XBP1P17861 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
XBP1P17861 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
XBP1P17861 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
XBP1P17861 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
XBP1P17861 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
XBP1P17861 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
XBP1P17861 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
XBP1P17861 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
XBP1P17861 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
XBP1P17861 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
XBP1P17861 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
XBP1P17861 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
XBP1P17861 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
XBP1P17861 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
XBP1P17861 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
XBP1P17861 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
XBP1P17861 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
XBP1P17861 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
XBP1P17861 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
XBP1P17861 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
XBP1P17861 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
XBP1P17861 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
XBP1P17861 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
XBP1P17861 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
XBP1P17861 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
XBP1P17861 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
XBP1P17861 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
XBP1P17861 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
XBP1P17861 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
XBP1P17861 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
XBP1P17861 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
XBP1P17861 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
XBP1P17861 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
XBP1P17861 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
XBP1P17861 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
XBP1P17861 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
XBP1P17861 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
XBP1P17861 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
XBP1P17861 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
XBP1P17861 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
XBP1P17861 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
XBP1P17861 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
XBP1P17861 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
XBP1P17861 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
XBP1P17861 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
XBP1P17861 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
XBP1P17861 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
XBP1P17861 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
XBP1P17861 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
XBP1P17861 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
XBP1P17861 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
XBP1P17861 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
XBP1P17861 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
XBP1P17861 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
XBP1P17861 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
XBP1P17861 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
XBP1P17861 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
XBP1P17861 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
XBP1P17861 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
XBP1P17861 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
XBP1P17861 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
XBP1P17861 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
XBP1P17861 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
XBP1P17861 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
XBP1P17861 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
XBP1P17861 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
XBP1P17861 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
XBP1P17861 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
XBP1P17861 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
XBP1P17861 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
XBP1P17861 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
XBP1P17861 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
XBP1P17861 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
XBP1P17861 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
XBP1P17861 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
XBP1P17861 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
XBP1P17861 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
XBP1P17861 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
XBP1P17861 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
XBP1P17861 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
XBP1P17861 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
XBP1P17861 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
XBP1P17861 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
XBP1P17861 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
XBP1P17861 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
XBP1P17861 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
XBP1P17861 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
XBP1P17861 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
XBP1P17861 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
XBP1P17861 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
XBP1P17861 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
XBP1P17861 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
XBP1P17861 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
XBP1P17861 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
XBP1P17861 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
XBP1P17861 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms