Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC10.11□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC10.11□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC10.11□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC10.11□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC10.11□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 ARHGAP31-201ENST00000264245 9317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC10.1□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms