Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ODC1P11926 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ODC1P11926 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ODC1P11926 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ODC1P11926 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ODC1P11926 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ODC1P11926 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ODC1P11926 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ODC1P11926 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ODC1P11926 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ODC1P11926 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ODC1P11926 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ODC1P11926 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ODC1P11926 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ODC1P11926 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ODC1P11926 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ODC1P11926 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ODC1P11926 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ODC1P11926 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ODC1P11926 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ODC1P11926 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ODC1P11926 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ODC1P11926 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ODC1P11926 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ODC1P11926 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ODC1P11926 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ODC1P11926 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ODC1P11926 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ODC1P11926 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ODC1P11926 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ODC1P11926 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ODC1P11926 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ODC1P11926 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ODC1P11926 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ODC1P11926 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ODC1P11926 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ODC1P11926 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ODC1P11926 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ODC1P11926 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ODC1P11926 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ODC1P11926 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ODC1P11926 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ODC1P11926 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ODC1P11926 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ODC1P11926 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ODC1P11926 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ODC1P11926 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ODC1P11926 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ODC1P11926 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ODC1P11926 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ODC1P11926 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ODC1P11926 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ODC1P11926 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ODC1P11926 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ODC1P11926 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ODC1P11926 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ODC1P11926 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ODC1P11926 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ODC1P11926 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ODC1P11926 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ODC1P11926 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ODC1P11926 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ODC1P11926 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ODC1P11926 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ODC1P11926 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ODC1P11926 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ODC1P11926 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ODC1P11926 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ODC1P11926 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ODC1P11926 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ODC1P11926 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ODC1P11926 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ODC1P11926 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ODC1P11926 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ODC1P11926 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ODC1P11926 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ODC1P11926 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ODC1P11926 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ODC1P11926 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ODC1P11926 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ODC1P11926 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ODC1P11926 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ODC1P11926 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ODC1P11926 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ODC1P11926 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ODC1P11926 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ODC1P11926 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ODC1P11926 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ODC1P11926 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ODC1P11926 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ODC1P11926 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ODC1P11926 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ODC1P11926 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ODC1P11926 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ODC1P11926 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ODC1P11926 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ODC1P11926 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ODC1P11926 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ODC1P11926 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ODC1P11926 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms