Protein–RNA interactions for Protein: P06454

PTMA, Prothymosin alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTMAP06454 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTMAP06454 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTMAP06454 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTMAP06454 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTMAP06454 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTMAP06454 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTMAP06454 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTMAP06454 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTMAP06454 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTMAP06454 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTMAP06454 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTMAP06454 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTMAP06454 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTMAP06454 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTMAP06454 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTMAP06454 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PTMAP06454 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PTMAP06454 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTMAP06454 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTMAP06454 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTMAP06454 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTMAP06454 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTMAP06454 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTMAP06454 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTMAP06454 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTMAP06454 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTMAP06454 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTMAP06454 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTMAP06454 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTMAP06454 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTMAP06454 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTMAP06454 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTMAP06454 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTMAP06454 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTMAP06454 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTMAP06454 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTMAP06454 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTMAP06454 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTMAP06454 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTMAP06454 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTMAP06454 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTMAP06454 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTMAP06454 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTMAP06454 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTMAP06454 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTMAP06454 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTMAP06454 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTMAP06454 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTMAP06454 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTMAP06454 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTMAP06454 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTMAP06454 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PTMAP06454 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTMAP06454 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTMAP06454 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTMAP06454 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTMAP06454 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTMAP06454 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTMAP06454 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTMAP06454 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTMAP06454 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTMAP06454 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTMAP06454 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTMAP06454 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTMAP06454 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTMAP06454 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PTMAP06454 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTMAP06454 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTMAP06454 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTMAP06454 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTMAP06454 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTMAP06454 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTMAP06454 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTMAP06454 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTMAP06454 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTMAP06454 DSE-201ENST00000331677 7237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTMAP06454 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTMAP06454 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTMAP06454 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTMAP06454 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTMAP06454 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTMAP06454 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTMAP06454 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTMAP06454 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTMAP06454 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTMAP06454 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTMAP06454 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTMAP06454 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTMAP06454 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTMAP06454 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTMAP06454 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTMAP06454 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PTMAP06454 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTMAP06454 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PTMAP06454 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTMAP06454 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PTMAP06454 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTMAP06454 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTMAP06454 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTMAP06454 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms