Protein–RNA interactions for Protein: O95237

LRAT, Lecithin retinol acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRATO95237 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRATO95237 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRATO95237 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRATO95237 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRATO95237 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRATO95237 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRATO95237 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRATO95237 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRATO95237 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRATO95237 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRATO95237 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRATO95237 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRATO95237 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRATO95237 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LRATO95237 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRATO95237 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRATO95237 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRATO95237 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRATO95237 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRATO95237 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRATO95237 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRATO95237 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LRATO95237 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LRATO95237 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LRATO95237 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRATO95237 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRATO95237 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRATO95237 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRATO95237 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRATO95237 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRATO95237 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRATO95237 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRATO95237 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRATO95237 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRATO95237 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRATO95237 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRATO95237 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRATO95237 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LRATO95237 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LRATO95237 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
LRATO95237 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LRATO95237 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LRATO95237 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LRATO95237 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LRATO95237 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LRATO95237 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LRATO95237 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRATO95237 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRATO95237 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRATO95237 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRATO95237 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LRATO95237 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LRATO95237 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRATO95237 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LRATO95237 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRATO95237 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRATO95237 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRATO95237 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LRATO95237 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRATO95237 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LRATO95237 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LRATO95237 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LRATO95237 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LRATO95237 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LRATO95237 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LRATO95237 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LRATO95237 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LRATO95237 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LRATO95237 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LRATO95237 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRATO95237 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LRATO95237 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRATO95237 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LRATO95237 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRATO95237 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRATO95237 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LRATO95237 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRATO95237 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRATO95237 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRATO95237 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LRATO95237 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LRATO95237 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LRATO95237 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRATO95237 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LRATO95237 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRATO95237 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LRATO95237 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
LRATO95237 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRATO95237 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LRATO95237 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRATO95237 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRATO95237 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LRATO95237 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LRATO95237 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LRATO95237 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LRATO95237 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LRATO95237 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRATO95237 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRATO95237 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRATO95237 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms