Protein–RNA interactions for Protein: O94855

SEC24D, Protein transport protein Sec24D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24DO94855 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC24DO94855 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC24DO94855 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC24DO94855 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC24DO94855 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC24DO94855 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC24DO94855 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC24DO94855 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC24DO94855 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC24DO94855 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC24DO94855 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC24DO94855 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC24DO94855 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC24DO94855 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC24DO94855 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC24DO94855 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC24DO94855 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC24DO94855 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC24DO94855 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC24DO94855 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC24DO94855 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC24DO94855 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC24DO94855 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC24DO94855 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC24DO94855 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC24DO94855 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC24DO94855 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC24DO94855 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC24DO94855 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC24DO94855 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC24DO94855 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC24DO94855 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC24DO94855 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC24DO94855 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC24DO94855 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC24DO94855 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC24DO94855 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC24DO94855 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC24DO94855 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC24DO94855 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC24DO94855 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC24DO94855 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC24DO94855 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC24DO94855 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC24DO94855 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC24DO94855 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC24DO94855 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC24DO94855 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC24DO94855 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC24DO94855 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC24DO94855 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC24DO94855 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC24DO94855 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC24DO94855 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC24DO94855 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC24DO94855 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC24DO94855 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC24DO94855 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC24DO94855 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC24DO94855 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC24DO94855 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC24DO94855 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC24DO94855 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC24DO94855 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC24DO94855 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC24DO94855 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC24DO94855 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC24DO94855 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC24DO94855 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC24DO94855 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC24DO94855 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC24DO94855 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC24DO94855 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC24DO94855 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC24DO94855 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC24DO94855 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC24DO94855 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC24DO94855 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC24DO94855 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC24DO94855 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC24DO94855 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC24DO94855 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC24DO94855 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC24DO94855 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC24DO94855 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC24DO94855 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC24DO94855 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC24DO94855 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC24DO94855 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC24DO94855 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC24DO94855 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC24DO94855 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC24DO94855 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC24DO94855 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC24DO94855 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC24DO94855 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC24DO94855 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC24DO94855 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC24DO94855 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC24DO94855 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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