Protein–RNA interactions for Protein: O43497

CACNA1G, Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha-1G, humanhuman

Predictions only

Length 2,377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1GO43497 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 CR392039.1-201ENST00000623217 204 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 FAM27E5-201ENST00000426869 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 RBM4-211ENST00000530235 1011 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 HIST1H1D-201ENST00000244534 666 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 C18orf21-202ENST00000333234 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
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