Protein–RNA interactions for Protein: O00622

CYR61, Protein CYR61, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYR61O00622 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CYR61O00622 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CYR61O00622 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CYR61O00622 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CYR61O00622 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CYR61O00622 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CYR61O00622 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CYR61O00622 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CYR61O00622 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CYR61O00622 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CYR61O00622 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CYR61O00622 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CYR61O00622 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CYR61O00622 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CYR61O00622 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CYR61O00622 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CYR61O00622 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CYR61O00622 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CYR61O00622 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CYR61O00622 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CYR61O00622 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CYR61O00622 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CYR61O00622 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CYR61O00622 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CYR61O00622 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CYR61O00622 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CYR61O00622 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CYR61O00622 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CYR61O00622 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CYR61O00622 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CYR61O00622 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CYR61O00622 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CYR61O00622 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CYR61O00622 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CYR61O00622 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CYR61O00622 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CYR61O00622 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CYR61O00622 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CYR61O00622 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CYR61O00622 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CYR61O00622 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CYR61O00622 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CYR61O00622 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CYR61O00622 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CYR61O00622 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CYR61O00622 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CYR61O00622 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CYR61O00622 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CYR61O00622 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CYR61O00622 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CYR61O00622 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CYR61O00622 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CYR61O00622 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CYR61O00622 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CYR61O00622 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CYR61O00622 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CYR61O00622 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CYR61O00622 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CYR61O00622 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CYR61O00622 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CYR61O00622 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CYR61O00622 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CYR61O00622 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CYR61O00622 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CYR61O00622 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CYR61O00622 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CYR61O00622 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CYR61O00622 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CYR61O00622 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CYR61O00622 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CYR61O00622 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CYR61O00622 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CYR61O00622 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CYR61O00622 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CYR61O00622 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CYR61O00622 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CYR61O00622 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CYR61O00622 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CYR61O00622 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CYR61O00622 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CYR61O00622 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CYR61O00622 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CYR61O00622 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CYR61O00622 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CYR61O00622 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CYR61O00622 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CYR61O00622 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CYR61O00622 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CYR61O00622 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CYR61O00622 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CYR61O00622 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CYR61O00622 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CYR61O00622 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CYR61O00622 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CYR61O00622 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CYR61O00622 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CYR61O00622 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CYR61O00622 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CYR61O00622 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CYR61O00622 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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