Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
E9PBE3 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E9PBE3 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E9PBE3 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E9PBE3 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E9PBE3 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E9PBE3 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E9PBE3 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E9PBE3 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
E9PBE3 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E9PBE3 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E9PBE3 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E9PBE3 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
E9PBE3 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
E9PBE3 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
E9PBE3 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
E9PBE3 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
E9PBE3 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E9PBE3 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E9PBE3 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
E9PBE3 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
E9PBE3 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E9PBE3 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E9PBE3 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
E9PBE3 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E9PBE3 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
E9PBE3 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E9PBE3 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
E9PBE3 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
E9PBE3 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
E9PBE3 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
E9PBE3 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E9PBE3 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E9PBE3 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E9PBE3 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E9PBE3 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E9PBE3 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E9PBE3 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E9PBE3 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E9PBE3 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E9PBE3 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E9PBE3 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
E9PBE3 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E9PBE3 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E9PBE3 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
E9PBE3 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E9PBE3 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E9PBE3 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E9PBE3 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E9PBE3 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E9PBE3 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E9PBE3 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E9PBE3 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E9PBE3 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E9PBE3 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E9PBE3 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E9PBE3 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E9PBE3 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E9PBE3 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E9PBE3 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
E9PBE3 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E9PBE3 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
E9PBE3 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E9PBE3 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E9PBE3 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E9PBE3 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E9PBE3 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E9PBE3 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E9PBE3 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E9PBE3 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E9PBE3 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E9PBE3 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E9PBE3 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E9PBE3 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E9PBE3 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E9PBE3 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E9PBE3 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E9PBE3 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E9PBE3 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E9PBE3 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E9PBE3 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
E9PBE3 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E9PBE3 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E9PBE3 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E9PBE3 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E9PBE3 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E9PBE3 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E9PBE3 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E9PBE3 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E9PBE3 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E9PBE3 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E9PBE3 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
E9PBE3 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E9PBE3 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E9PBE3 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E9PBE3 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E9PBE3 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E9PBE3 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E9PBE3 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E9PBE3 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms