Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC18.64■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms