Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HMGB1P1B2RPK0 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms