Protein–RNA interactions for Protein: A6NKP2

SDR42E2, Putative short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 2, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDR42E2A6NKP2 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SDR42E2A6NKP2 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms