Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MAP3K4Q9Y6R4 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MAP3K4Q9Y6R4 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MAP3K4Q9Y6R4 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MAP3K4Q9Y6R4 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MAP3K4Q9Y6R4 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MAP3K4Q9Y6R4 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MAP3K4Q9Y6R4 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
MAP3K4Q9Y6R4 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MAP3K4Q9Y6R4 AC069208.1-205ENST00000456299 576 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MAP3K4Q9Y6R4 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
MAP3K4Q9Y6R4 HTATIP2-205ENST00000530266 713 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MAP3K4Q9Y6R4 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MAP3K4Q9Y6R4 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MAP3K4Q9Y6R4 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MAP3K4Q9Y6R4 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MAP3K4Q9Y6R4 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MAP3K4Q9Y6R4 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MAP3K4Q9Y6R4 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MAP3K4Q9Y6R4 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MAP3K4Q9Y6R4 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MAP3K4Q9Y6R4 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MAP3K4Q9Y6R4 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MAP3K4Q9Y6R4 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MAP3K4Q9Y6R4 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MAP3K4Q9Y6R4 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MAP3K4Q9Y6R4 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MAP3K4Q9Y6R4 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MAP3K4Q9Y6R4 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
MAP3K4Q9Y6R4 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
MAP3K4Q9Y6R4 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MAP3K4Q9Y6R4 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
MAP3K4Q9Y6R4 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MAP3K4Q9Y6R4 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MAP3K4Q9Y6R4 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MAP3K4Q9Y6R4 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MAP3K4Q9Y6R4 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MAP3K4Q9Y6R4 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MAP3K4Q9Y6R4 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MAP3K4Q9Y6R4 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MAP3K4Q9Y6R4 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MAP3K4Q9Y6R4 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MAP3K4Q9Y6R4 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MAP3K4Q9Y6R4 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MAP3K4Q9Y6R4 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MAP3K4Q9Y6R4 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MAP3K4Q9Y6R4 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MAP3K4Q9Y6R4 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MAP3K4Q9Y6R4 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MAP3K4Q9Y6R4 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MAP3K4Q9Y6R4 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MAP3K4Q9Y6R4 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MAP3K4Q9Y6R4 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MAP3K4Q9Y6R4 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MAP3K4Q9Y6R4 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MAP3K4Q9Y6R4 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MAP3K4Q9Y6R4 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MAP3K4Q9Y6R4 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MAP3K4Q9Y6R4 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MAP3K4Q9Y6R4 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
MAP3K4Q9Y6R4 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
MAP3K4Q9Y6R4 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MAP3K4Q9Y6R4 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
MAP3K4Q9Y6R4 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MAP3K4Q9Y6R4 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MAP3K4Q9Y6R4 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MAP3K4Q9Y6R4 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MAP3K4Q9Y6R4 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 AC018695.6-201ENST00000614011 534 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MAP3K4Q9Y6R4 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms