Protein–RNA interactions for Protein: Q9UII6

DUSP13, Dual specificity protein phosphatase 13 isoform B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP13Q9UII6 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DUSP13Q9UII6 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DUSP13Q9UII6 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DUSP13Q9UII6 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DUSP13Q9UII6 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DUSP13Q9UII6 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DUSP13Q9UII6 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DUSP13Q9UII6 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DUSP13Q9UII6 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DUSP13Q9UII6 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DUSP13Q9UII6 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DUSP13Q9UII6 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DUSP13Q9UII6 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DUSP13Q9UII6 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
DUSP13Q9UII6 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DUSP13Q9UII6 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DUSP13Q9UII6 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DUSP13Q9UII6 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DUSP13Q9UII6 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DUSP13Q9UII6 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DUSP13Q9UII6 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DUSP13Q9UII6 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DUSP13Q9UII6 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DUSP13Q9UII6 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
DUSP13Q9UII6 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DUSP13Q9UII6 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DUSP13Q9UII6 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DUSP13Q9UII6 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
DUSP13Q9UII6 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DUSP13Q9UII6 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DUSP13Q9UII6 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DUSP13Q9UII6 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DUSP13Q9UII6 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DUSP13Q9UII6 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DUSP13Q9UII6 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DUSP13Q9UII6 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DUSP13Q9UII6 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DUSP13Q9UII6 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DUSP13Q9UII6 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DUSP13Q9UII6 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DUSP13Q9UII6 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DUSP13Q9UII6 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DUSP13Q9UII6 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DUSP13Q9UII6 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DUSP13Q9UII6 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DUSP13Q9UII6 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DUSP13Q9UII6 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DUSP13Q9UII6 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DUSP13Q9UII6 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DUSP13Q9UII6 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DUSP13Q9UII6 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DUSP13Q9UII6 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DUSP13Q9UII6 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DUSP13Q9UII6 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DUSP13Q9UII6 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DUSP13Q9UII6 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DUSP13Q9UII6 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DUSP13Q9UII6 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DUSP13Q9UII6 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DUSP13Q9UII6 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DUSP13Q9UII6 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DUSP13Q9UII6 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DUSP13Q9UII6 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DUSP13Q9UII6 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DUSP13Q9UII6 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DUSP13Q9UII6 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DUSP13Q9UII6 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DUSP13Q9UII6 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DUSP13Q9UII6 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DUSP13Q9UII6 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DUSP13Q9UII6 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DUSP13Q9UII6 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DUSP13Q9UII6 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DUSP13Q9UII6 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
DUSP13Q9UII6 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DUSP13Q9UII6 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
DUSP13Q9UII6 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
DUSP13Q9UII6 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DUSP13Q9UII6 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
DUSP13Q9UII6 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DUSP13Q9UII6 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DUSP13Q9UII6 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
DUSP13Q9UII6 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DUSP13Q9UII6 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DUSP13Q9UII6 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DUSP13Q9UII6 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
DUSP13Q9UII6 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DUSP13Q9UII6 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DUSP13Q9UII6 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DUSP13Q9UII6 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DUSP13Q9UII6 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DUSP13Q9UII6 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DUSP13Q9UII6 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DUSP13Q9UII6 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DUSP13Q9UII6 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DUSP13Q9UII6 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DUSP13Q9UII6 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DUSP13Q9UII6 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DUSP13Q9UII6 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DUSP13Q9UII6 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms