Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLIP2Q9UDT6 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLIP2Q9UDT6 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLIP2Q9UDT6 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLIP2Q9UDT6 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLIP2Q9UDT6 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLIP2Q9UDT6 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CLIP2Q9UDT6 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CLIP2Q9UDT6 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CLIP2Q9UDT6 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CLIP2Q9UDT6 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CLIP2Q9UDT6 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CLIP2Q9UDT6 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CLIP2Q9UDT6 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CLIP2Q9UDT6 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CLIP2Q9UDT6 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CLIP2Q9UDT6 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CLIP2Q9UDT6 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CLIP2Q9UDT6 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLIP2Q9UDT6 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLIP2Q9UDT6 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CLIP2Q9UDT6 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLIP2Q9UDT6 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CLIP2Q9UDT6 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CLIP2Q9UDT6 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLIP2Q9UDT6 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLIP2Q9UDT6 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLIP2Q9UDT6 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLIP2Q9UDT6 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLIP2Q9UDT6 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CLIP2Q9UDT6 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLIP2Q9UDT6 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLIP2Q9UDT6 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLIP2Q9UDT6 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLIP2Q9UDT6 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLIP2Q9UDT6 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLIP2Q9UDT6 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLIP2Q9UDT6 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLIP2Q9UDT6 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CLIP2Q9UDT6 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CLIP2Q9UDT6 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLIP2Q9UDT6 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLIP2Q9UDT6 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLIP2Q9UDT6 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLIP2Q9UDT6 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLIP2Q9UDT6 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLIP2Q9UDT6 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLIP2Q9UDT6 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLIP2Q9UDT6 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLIP2Q9UDT6 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLIP2Q9UDT6 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLIP2Q9UDT6 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLIP2Q9UDT6 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLIP2Q9UDT6 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLIP2Q9UDT6 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLIP2Q9UDT6 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLIP2Q9UDT6 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLIP2Q9UDT6 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLIP2Q9UDT6 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLIP2Q9UDT6 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLIP2Q9UDT6 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLIP2Q9UDT6 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLIP2Q9UDT6 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CLIP2Q9UDT6 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLIP2Q9UDT6 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLIP2Q9UDT6 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLIP2Q9UDT6 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLIP2Q9UDT6 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLIP2Q9UDT6 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLIP2Q9UDT6 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CLIP2Q9UDT6 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLIP2Q9UDT6 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLIP2Q9UDT6 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CLIP2Q9UDT6 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CLIP2Q9UDT6 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLIP2Q9UDT6 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLIP2Q9UDT6 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLIP2Q9UDT6 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLIP2Q9UDT6 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLIP2Q9UDT6 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLIP2Q9UDT6 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CLIP2Q9UDT6 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLIP2Q9UDT6 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLIP2Q9UDT6 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLIP2Q9UDT6 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLIP2Q9UDT6 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLIP2Q9UDT6 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLIP2Q9UDT6 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLIP2Q9UDT6 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLIP2Q9UDT6 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLIP2Q9UDT6 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLIP2Q9UDT6 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLIP2Q9UDT6 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLIP2Q9UDT6 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLIP2Q9UDT6 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLIP2Q9UDT6 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLIP2Q9UDT6 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLIP2Q9UDT6 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLIP2Q9UDT6 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLIP2Q9UDT6 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 143.1 ms