Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms