Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SYCP2Q9BX26 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SYCP2Q9BX26 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYCP2Q9BX26 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYCP2Q9BX26 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYCP2Q9BX26 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYCP2Q9BX26 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYCP2Q9BX26 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYCP2Q9BX26 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYCP2Q9BX26 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms