Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWC9

CCDC106, Coiled-coil domain-containing protein 106, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC106Q9BWC9 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC106Q9BWC9 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC106Q9BWC9 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC106Q9BWC9 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC106Q9BWC9 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC106Q9BWC9 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC106Q9BWC9 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC106Q9BWC9 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC106Q9BWC9 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC106Q9BWC9 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC106Q9BWC9 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC106Q9BWC9 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC106Q9BWC9 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC106Q9BWC9 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC106Q9BWC9 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC106Q9BWC9 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC106Q9BWC9 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC106Q9BWC9 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC106Q9BWC9 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC106Q9BWC9 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC106Q9BWC9 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC106Q9BWC9 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC106Q9BWC9 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC106Q9BWC9 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC106Q9BWC9 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC106Q9BWC9 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC106Q9BWC9 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC106Q9BWC9 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC106Q9BWC9 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC106Q9BWC9 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC106Q9BWC9 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC106Q9BWC9 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC106Q9BWC9 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC106Q9BWC9 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC106Q9BWC9 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC106Q9BWC9 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC106Q9BWC9 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC106Q9BWC9 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC106Q9BWC9 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC106Q9BWC9 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC106Q9BWC9 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC106Q9BWC9 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC106Q9BWC9 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC106Q9BWC9 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC106Q9BWC9 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC106Q9BWC9 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC106Q9BWC9 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC106Q9BWC9 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC106Q9BWC9 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC106Q9BWC9 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC106Q9BWC9 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC106Q9BWC9 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC106Q9BWC9 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC106Q9BWC9 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC106Q9BWC9 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC106Q9BWC9 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC106Q9BWC9 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC106Q9BWC9 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC106Q9BWC9 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC106Q9BWC9 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC106Q9BWC9 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC106Q9BWC9 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC106Q9BWC9 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC106Q9BWC9 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC106Q9BWC9 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC106Q9BWC9 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC106Q9BWC9 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC106Q9BWC9 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC106Q9BWC9 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC106Q9BWC9 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC106Q9BWC9 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC106Q9BWC9 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC106Q9BWC9 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC106Q9BWC9 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC106Q9BWC9 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC106Q9BWC9 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC106Q9BWC9 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC106Q9BWC9 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC106Q9BWC9 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC106Q9BWC9 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC106Q9BWC9 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC106Q9BWC9 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC106Q9BWC9 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC106Q9BWC9 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC106Q9BWC9 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC106Q9BWC9 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC106Q9BWC9 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms