Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTM1

H2AFJ, Histone H2A.J, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFJQ9BTM1 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2AFJQ9BTM1 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms