Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF4

TIMM29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM29Q9BSF4 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TIMM29Q9BSF4 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.6 ms