Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP7

MGME1, Mitochondrial genome maintenance exonuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGME1Q9BQP7 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms