Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms