Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms