Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
COG3Q96JB2 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms