Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RUNDC1Q96C34 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RUNDC1Q96C34 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RUNDC1Q96C34 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RUNDC1Q96C34 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RUNDC1Q96C34 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RUNDC1Q96C34 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RUNDC1Q96C34 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RUNDC1Q96C34 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RUNDC1Q96C34 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RUNDC1Q96C34 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RUNDC1Q96C34 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RUNDC1Q96C34 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RUNDC1Q96C34 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RUNDC1Q96C34 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RUNDC1Q96C34 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RUNDC1Q96C34 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RUNDC1Q96C34 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RUNDC1Q96C34 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RUNDC1Q96C34 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RUNDC1Q96C34 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RUNDC1Q96C34 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RUNDC1Q96C34 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RUNDC1Q96C34 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RUNDC1Q96C34 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RUNDC1Q96C34 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RUNDC1Q96C34 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RUNDC1Q96C34 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RUNDC1Q96C34 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RUNDC1Q96C34 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RUNDC1Q96C34 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RUNDC1Q96C34 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RUNDC1Q96C34 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RUNDC1Q96C34 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RUNDC1Q96C34 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RUNDC1Q96C34 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RUNDC1Q96C34 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RUNDC1Q96C34 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RUNDC1Q96C34 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RUNDC1Q96C34 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RUNDC1Q96C34 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RUNDC1Q96C34 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RUNDC1Q96C34 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RUNDC1Q96C34 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RUNDC1Q96C34 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RUNDC1Q96C34 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RUNDC1Q96C34 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RUNDC1Q96C34 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RUNDC1Q96C34 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RUNDC1Q96C34 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RUNDC1Q96C34 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RUNDC1Q96C34 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RUNDC1Q96C34 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RUNDC1Q96C34 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RUNDC1Q96C34 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RUNDC1Q96C34 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RUNDC1Q96C34 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RUNDC1Q96C34 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RUNDC1Q96C34 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RUNDC1Q96C34 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RUNDC1Q96C34 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RUNDC1Q96C34 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RUNDC1Q96C34 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RUNDC1Q96C34 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RUNDC1Q96C34 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RUNDC1Q96C34 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RUNDC1Q96C34 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms