Protein–RNA interactions for Protein: Q96B33

CLDN23, Claudin-23, humanhuman

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CLDN23Q96B33 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN23Q96B33 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN23Q96B33 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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CLDN23Q96B33 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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CLDN23Q96B33 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
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CLDN23Q96B33 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN23Q96B33 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN23Q96B33 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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CLDN23Q96B33 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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CLDN23Q96B33 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN23Q96B33 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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CLDN23Q96B33 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN23Q96B33 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN23Q96B33 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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CLDN23Q96B33 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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CLDN23Q96B33 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN23Q96B33 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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CLDN23Q96B33 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN23Q96B33 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN23Q96B33 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN23Q96B33 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN23Q96B33 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN23Q96B33 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN23Q96B33 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN23Q96B33 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN23Q96B33 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN23Q96B33 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN23Q96B33 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN23Q96B33 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN23Q96B33 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN23Q96B33 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN23Q96B33 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN23Q96B33 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN23Q96B33 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN23Q96B33 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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