Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TOPBP1Q92547 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TOPBP1Q92547 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TOPBP1Q92547 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TOPBP1Q92547 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TOPBP1Q92547 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TOPBP1Q92547 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TOPBP1Q92547 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TOPBP1Q92547 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TOPBP1Q92547 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TOPBP1Q92547 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TOPBP1Q92547 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TOPBP1Q92547 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TOPBP1Q92547 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TOPBP1Q92547 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TOPBP1Q92547 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TOPBP1Q92547 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TOPBP1Q92547 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TOPBP1Q92547 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TOPBP1Q92547 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TOPBP1Q92547 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TOPBP1Q92547 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TOPBP1Q92547 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TOPBP1Q92547 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TOPBP1Q92547 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TOPBP1Q92547 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TOPBP1Q92547 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TOPBP1Q92547 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TOPBP1Q92547 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TOPBP1Q92547 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TOPBP1Q92547 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TOPBP1Q92547 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TOPBP1Q92547 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TOPBP1Q92547 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TOPBP1Q92547 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TOPBP1Q92547 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TOPBP1Q92547 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TOPBP1Q92547 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TOPBP1Q92547 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TOPBP1Q92547 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TOPBP1Q92547 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TOPBP1Q92547 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TOPBP1Q92547 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TOPBP1Q92547 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TOPBP1Q92547 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TOPBP1Q92547 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TOPBP1Q92547 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TOPBP1Q92547 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TOPBP1Q92547 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TOPBP1Q92547 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TOPBP1Q92547 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TOPBP1Q92547 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TOPBP1Q92547 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TOPBP1Q92547 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TOPBP1Q92547 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TOPBP1Q92547 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TOPBP1Q92547 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TOPBP1Q92547 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TOPBP1Q92547 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TOPBP1Q92547 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TOPBP1Q92547 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TOPBP1Q92547 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TOPBP1Q92547 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TOPBP1Q92547 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TOPBP1Q92547 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TOPBP1Q92547 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TOPBP1Q92547 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TOPBP1Q92547 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TOPBP1Q92547 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TOPBP1Q92547 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TOPBP1Q92547 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TOPBP1Q92547 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TOPBP1Q92547 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TOPBP1Q92547 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TOPBP1Q92547 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TOPBP1Q92547 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TOPBP1Q92547 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TOPBP1Q92547 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TOPBP1Q92547 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TOPBP1Q92547 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TOPBP1Q92547 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TOPBP1Q92547 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TOPBP1Q92547 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TOPBP1Q92547 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TOPBP1Q92547 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TOPBP1Q92547 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TOPBP1Q92547 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TOPBP1Q92547 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TOPBP1Q92547 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TOPBP1Q92547 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TOPBP1Q92547 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TOPBP1Q92547 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TOPBP1Q92547 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TOPBP1Q92547 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TOPBP1Q92547 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TOPBP1Q92547 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TOPBP1Q92547 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TOPBP1Q92547 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TOPBP1Q92547 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TOPBP1Q92547 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.7 ms