Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ69

C11orf40, Putative uncharacterized protein C11orf40, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf40Q8WZ69 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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C11orf40Q8WZ69 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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C11orf40Q8WZ69 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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C11orf40Q8WZ69 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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C11orf40Q8WZ69 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C11orf40Q8WZ69 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C11orf40Q8WZ69 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C11orf40Q8WZ69 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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C11orf40Q8WZ69 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C11orf40Q8WZ69 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C11orf40Q8WZ69 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C11orf40Q8WZ69 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C11orf40Q8WZ69 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C11orf40Q8WZ69 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C11orf40Q8WZ69 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C11orf40Q8WZ69 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
C11orf40Q8WZ69 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C11orf40Q8WZ69 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C11orf40Q8WZ69 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
C11orf40Q8WZ69 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
C11orf40Q8WZ69 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C11orf40Q8WZ69 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
C11orf40Q8WZ69 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C11orf40Q8WZ69 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C11orf40Q8WZ69 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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