Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCG3Q8WXD2 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms