Protein–RNA interactions for Protein: Q8WTU0

DDI1, Protein DDI1 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDI1Q8WTU0 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DDI1Q8WTU0 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
DDI1Q8WTU0 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DDI1Q8WTU0 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DDI1Q8WTU0 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
DDI1Q8WTU0 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
DDI1Q8WTU0 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DDI1Q8WTU0 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DDI1Q8WTU0 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DDI1Q8WTU0 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DDI1Q8WTU0 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
DDI1Q8WTU0 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DDI1Q8WTU0 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DDI1Q8WTU0 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DDI1Q8WTU0 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DDI1Q8WTU0 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DDI1Q8WTU0 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
DDI1Q8WTU0 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
DDI1Q8WTU0 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DDI1Q8WTU0 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
DDI1Q8WTU0 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DDI1Q8WTU0 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DDI1Q8WTU0 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
DDI1Q8WTU0 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DDI1Q8WTU0 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DDI1Q8WTU0 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DDI1Q8WTU0 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
DDI1Q8WTU0 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DDI1Q8WTU0 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DDI1Q8WTU0 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DDI1Q8WTU0 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DDI1Q8WTU0 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DDI1Q8WTU0 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DDI1Q8WTU0 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DDI1Q8WTU0 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DDI1Q8WTU0 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DDI1Q8WTU0 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
DDI1Q8WTU0 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DDI1Q8WTU0 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DDI1Q8WTU0 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
DDI1Q8WTU0 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
DDI1Q8WTU0 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DDI1Q8WTU0 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
DDI1Q8WTU0 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DDI1Q8WTU0 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DDI1Q8WTU0 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DDI1Q8WTU0 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DDI1Q8WTU0 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
DDI1Q8WTU0 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
DDI1Q8WTU0 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DDI1Q8WTU0 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DDI1Q8WTU0 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DDI1Q8WTU0 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DDI1Q8WTU0 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DDI1Q8WTU0 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
DDI1Q8WTU0 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DDI1Q8WTU0 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DDI1Q8WTU0 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DDI1Q8WTU0 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DDI1Q8WTU0 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
DDI1Q8WTU0 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DDI1Q8WTU0 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DDI1Q8WTU0 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DDI1Q8WTU0 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DDI1Q8WTU0 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DDI1Q8WTU0 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDI1Q8WTU0 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDI1Q8WTU0 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDI1Q8WTU0 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDI1Q8WTU0 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDI1Q8WTU0 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDI1Q8WTU0 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDI1Q8WTU0 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDI1Q8WTU0 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDI1Q8WTU0 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDI1Q8WTU0 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDI1Q8WTU0 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDI1Q8WTU0 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDI1Q8WTU0 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDI1Q8WTU0 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDI1Q8WTU0 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDI1Q8WTU0 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDI1Q8WTU0 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDI1Q8WTU0 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDI1Q8WTU0 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDI1Q8WTU0 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
DDI1Q8WTU0 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDI1Q8WTU0 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDI1Q8WTU0 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDI1Q8WTU0 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDI1Q8WTU0 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDI1Q8WTU0 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDI1Q8WTU0 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDI1Q8WTU0 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
DDI1Q8WTU0 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
DDI1Q8WTU0 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDI1Q8WTU0 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDI1Q8WTU0 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDI1Q8WTU0 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDI1Q8WTU0 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.6 ms