Protein–RNA interactions for Protein: Q8TC90

CCER1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCER1Q8TC90 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCER1Q8TC90 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCER1Q8TC90 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCER1Q8TC90 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCER1Q8TC90 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCER1Q8TC90 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCER1Q8TC90 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCER1Q8TC90 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCER1Q8TC90 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCER1Q8TC90 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCER1Q8TC90 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCER1Q8TC90 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCER1Q8TC90 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCER1Q8TC90 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CCER1Q8TC90 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCER1Q8TC90 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCER1Q8TC90 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CCER1Q8TC90 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCER1Q8TC90 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCER1Q8TC90 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCER1Q8TC90 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCER1Q8TC90 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCER1Q8TC90 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCER1Q8TC90 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCER1Q8TC90 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCER1Q8TC90 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCER1Q8TC90 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCER1Q8TC90 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCER1Q8TC90 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCER1Q8TC90 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCER1Q8TC90 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCER1Q8TC90 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCER1Q8TC90 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCER1Q8TC90 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCER1Q8TC90 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCER1Q8TC90 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCER1Q8TC90 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCER1Q8TC90 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCER1Q8TC90 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CCER1Q8TC90 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCER1Q8TC90 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCER1Q8TC90 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCER1Q8TC90 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CCER1Q8TC90 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCER1Q8TC90 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCER1Q8TC90 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCER1Q8TC90 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCER1Q8TC90 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCER1Q8TC90 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCER1Q8TC90 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCER1Q8TC90 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCER1Q8TC90 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCER1Q8TC90 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCER1Q8TC90 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCER1Q8TC90 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCER1Q8TC90 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCER1Q8TC90 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCER1Q8TC90 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCER1Q8TC90 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCER1Q8TC90 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCER1Q8TC90 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCER1Q8TC90 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCER1Q8TC90 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCER1Q8TC90 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCER1Q8TC90 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCER1Q8TC90 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCER1Q8TC90 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCER1Q8TC90 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCER1Q8TC90 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCER1Q8TC90 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCER1Q8TC90 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCER1Q8TC90 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCER1Q8TC90 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCER1Q8TC90 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCER1Q8TC90 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCER1Q8TC90 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCER1Q8TC90 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCER1Q8TC90 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCER1Q8TC90 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCER1Q8TC90 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCER1Q8TC90 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCER1Q8TC90 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCER1Q8TC90 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCER1Q8TC90 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCER1Q8TC90 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCER1Q8TC90 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCER1Q8TC90 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCER1Q8TC90 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCER1Q8TC90 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CCER1Q8TC90 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCER1Q8TC90 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCER1Q8TC90 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCER1Q8TC90 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCER1Q8TC90 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCER1Q8TC90 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CCER1Q8TC90 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCER1Q8TC90 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCER1Q8TC90 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCER1Q8TC90 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCER1Q8TC90 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms