Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6D2

RNF182, E3 ubiquitin-protein ligase RNF182, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF182Q8N6D2 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC11.98□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RNF182Q8N6D2 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms