Protein–RNA interactions for Protein: Q86V59

PNMA8A, Paraneoplastic antigen-like protein 8A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA8AQ86V59 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PNMA8AQ86V59 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PNMA8AQ86V59 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PNMA8AQ86V59 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PNMA8AQ86V59 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PNMA8AQ86V59 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PNMA8AQ86V59 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PNMA8AQ86V59 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PNMA8AQ86V59 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PNMA8AQ86V59 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PNMA8AQ86V59 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PNMA8AQ86V59 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PNMA8AQ86V59 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PNMA8AQ86V59 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PNMA8AQ86V59 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PNMA8AQ86V59 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PNMA8AQ86V59 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PNMA8AQ86V59 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PNMA8AQ86V59 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PNMA8AQ86V59 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PNMA8AQ86V59 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms