Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z614

SNX20, Sorting nexin-20, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX20Q7Z614 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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SNX20Q7Z614 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
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SNX20Q7Z614 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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SNX20Q7Z614 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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SNX20Q7Z614 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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SNX20Q7Z614 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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SNX20Q7Z614 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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