Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHLHA9Q7RTU4 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.9 ms